玉米脫粒機作業結束后要及時 機器內附著的塵土和其它雜物將松動的螺絲擰緊卸下傳動帶有輸送帶與鏈帶也要卸下。傳動帶上的油污要用肥皂水清洗干凈晾干后單獨掛在墻壁上以老化。卸下的鏈帶要用煤油洗凈并在機油內浸一下單獨存放。各部位軸承、黃油嘴孔用煤油進行清洗后重新注滿黃油。對全機的摩擦表面及各個螺絲都要涂上機油以防生銹。
在對玉米脫粒機進行潔機、保養過程中若發現有損壞的地方或零配件變形的當時不能修好還原 要在來年使用前修好才能進行脫粒作業以免發生 事故。在保管放置脫粒機時四腿腳要支墊平穩并用塑料布遮蔽好防塵。保管棚室要通風干燥嚴防屋面漏水或地面返潮導致機體腐蝕生銹而縮短使用壽命。